石正丽团队再颁布8个beta-冠状病毒的基果序列

要害词：冠状病毒；石正丽

2021年5月21日，石正丽团队在bioRxiv上传了一篇预印版论文引起了遍及存眷，这项研究报道了之前该组发觉的9种beta-冠状病毒除RaTG13以外的其他病毒，从而取消了许多推测。

在这篇预印版论文中，该组报道了除RaTG13外的别的8种beta-冠状病毒具有99.7%的基因序列同源性，是以，该研究组选用RaTG15这一蝙蝠冠状病毒毒株（SARS-rCoV）代表这些病毒。

RaTG15与SARS-CoV-2具有77.6%基因序列同源性，低于RaTG13。它与SARS-CoV-1具有74.4%基因序列同源性。此中在ORF1b地区，RaTG15与SARS-CoV-2具有97.2%的氨基酸序列同源性。

更为有味的是，RaTG15受体联合域（RBD）联合并利用中华菊头蝠ACE2（RaACE2）而非人ACE2作为进入细胞的受体，是以亲缘性与SARS-CoV-2另有必然间隔。

而穿山甲冠状病毒PCoV的RBD则与SARS-CoV-2高度同源，并可以联合人的ACE2。

这项研究实在是将之前许多人扣问的除了RaTG13以外其他在云南省墨江县通关镇发觉的beta-冠状病毒的序列信息举行了颁布以重视听。

编者按：

简洁回忆一下石正丽团队之前陈诉过的蝙蝠冠状病毒。

石正丽研究组2020年2月在Nature报道了新型冠状病毒SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒RaTG13具有96.2%序列同源性。

病毒所 （武汉） - 冠状病毒研究 - 海鲜市场 - 新型冠状病毒流传 （武汉）；这组要害词让人浮想联翩。

为此，在2020年11月，石正丽研究组在Nature上传了一篇附录，细致地先容了她发觉蝙蝠冠状病毒RaTG13的全历程。这一发觉颁发在了2016年的《中国病毒学》。

在更新的附录，这则附录报道了该试验室于2012年7月1日至10月1日从昆明医科大学隶属第一病院的4名严峻呼吸疾病患者中网络了13个血清样本。这些患者曾赴云南省墨江县通关镇的一个岩穴清算蝙蝠粪便，以便开采铜矿。这些患者后于2012年4月26-27日由于肺炎收治入院，病院从6-9月一连收罗了这些患者样本。

在COVID-19发作后，该研究组对这些样品举行了SARS-CoV-2核衣壳（与蝙蝠SARSr-CoV具有90%以上氨基酸序列同源性）的抗体检测，这些患者样品为阴性，提示这些患者没有熏染SARS-CoV-2，也很大概没有熏染过蝙蝠的SARSr-CoV。

在最初发觉这些病例的2012年至2015年之间，该研究组每年在这个窟窿中采样1-2次，共网络了1,322个动物样本，检测出293种高度多样性的冠状病毒。依据这些病毒RNA聚合酶的测序效果，研究职员发觉此中284种为alpha-冠状病毒，9种为beta-冠状病毒。这9种beta-冠状病毒均为SARS-CoV家属病毒，但并非熏染人类的人类SARS-CoV（RdRp序列差别极大），而是仅熏染蝙蝠的SARSr-CoV。

此中样品ID4991，被定名为Ra-TG-13（Ra表现蝙蝠泉源，TG表现通关镇，13表现发觉于2013年）。这个病毒序列在2016年上传至GenBank，ID为KP876546。2018年该组对RaTG13举行了病毒基因组测序。

2020年，在SARS-CoV-2发觉后，该组对这一病毒与RaTG13举行了序列比对，发觉两者序列同源性为96.2%。

RaTG13和SAR-CoV-2只是有高度同源性，但从RaTG13进化为2019-nCoV必要25至65年；根据方才颁布的基因序列，RaTG15明显间隔SAR-CoV-2更远。随着剩下的8个beta冠状病毒的基因序列也已公布，诡计论也该彻底消逝了。

讲到这里，我们也对石正丽颁发的论文做一简洁梳理，如许会更一览无余。

石正丽团队颁发的论文高度会合在蝙蝠冠状病毒。

从2006年的论文，该研究组就发觉了两株SARS样冠状病毒。今后，该研究组一向在分散和判定SARS样冠状病毒。

只是很惋惜，武汉做了这么多SARS样冠状病毒研究，真正产生了新型冠状病毒在武汉人群中流传时，却仍旧难以第临时间诊断和处置惩罚。

这也表现出了国度新建立“疾病防备操纵局”的须要性。必要有一个独立、专业且有权利的机构来处置惩罚大众卫肇事件。

假如我们检察石正丽团队最新颁发的研究论文时，会发觉，许多论文颁发在了Nature、Science、Cell、Lancet、JAMA等顶刊。

而这背后，是十几年脚踏实地、用心专注于冠状病毒研究。

这现实上也是科学家的近况和代价。

或许，一辈子做研究，也是冷静无闻、乃至做冷板凳。但社会有了这个遍及的积存，在突发变乱、大概科学技能有了突破点时，就会敏捷转化成旋转局势的生产力。

这一点，美国做得最好，mRNA疫苗、卵白疫苗、疫苗佐剂、治疗用的单抗等都在此次COVID-19遭遇战中异军突起。中国在进修、在前进；我们坚信，在应对下一个雷同“新冠大瘟疫”时，中国粹者肯定会做得更好。

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