「快讯」UK Bio-bank参加者的外显子组测序突出天然变同、基果功效
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作者：Joe
导读：Regeneron Genetics Center (RGC) 的研究职员和他们的同事发觉了数百个导致差别性状和疾病的基因，通过对来自英国生物银行（UK Bio-bank，一家极具影响力且范围最大的数据平台）的45万多人的外显子组测序。正如他们周一在《天然》杂志上报道的那样，研究职员发觉了500多个具有这种特质联系关系的基因，包罗一些增添肝病等疾病危险的基因，以及其他低落高血压和哮喘等疾病危险的基因。
研究职员可以或许使用生物银行参加者体内发觉的天然基因变异，开始梳理出卵白质编码基因的变异大概孕育发生的影响，这大概有助于确定某些基因的生物学功效，并给出新的治疗计谋。他们共鸣别了1200万个编码变体，并测试了它们是否与约莫4000个与人体康健相干的表征有关。
由Manuel Ferreira和Gonçalo Abecasis向导的RGC研究职员在他们的论文中写道：“这种奇特的编码变异名目，再加上大量样本和数以千计的可用表征，在亘古未有的范围上以评估基因功效，提供了一个奇特的时机。”
英国生物银行外显子组测序协会对454 , 787名生物银行参加者的外显子组举行了20倍或更高妙度的测序。在确定的1，230万个变异中，340万个是同义突变，790 万是错义突变，约915 , 000是假定的功效丧失（pLOF）突变。科学家们测试了有害的错义突变和功效丧失（pLOF）突变之间的联系关系，以及在行列步队中丈量的3994个与康健相干的表征。
在约莫23亿次联系关系测试之后，起首存眷来自欧洲血统的生物银行参加者的WES数据，研究职员发觉了8865个明显联系关系，涉及564个基因、492本性状和2283个基因-性状对。在133 , 370人的独立行列步队中，共复制了81%的联系关系。
一些变体-性状的联系关系彷佛是具有爱护性的，并与较低的疾病危险相干联。比方，研究职员细致到此前报道的PCSK9、APOB、APOC3与防备高脂血症的干系。别的，利用更宽松的明显性阈值，他们发觉SLC9A3R2（编码在肾脏中表达的脚手架卵白）与低血压危险之间的联系关系，以及SLC27A3的突变与儿童哮喘危险的低落之间的联络。
别的131个基因对多本性状有爱护作用。比方，FAM234A中的功效丧失（pLOF）变异与较低的血糖程度相干，而ASGR1的突变与载脂卵白B程度较低相干。
研究职员细致到，像如许的爱护性变异的辨认是格外感兴趣的，由于它们大概指向可以被抗体或其他按捺剂阻断的基因作为治疗。
研究职员还使用从非洲、东亚和南亚血统的人种网络来的WES数据举行了联系关系阐发。他们发觉，很多联系关系在其先人之间存在，格外是多本性状。但二元性状的联系关系较少，他们将其归因于低能量原因。
在本周美国人类遗传学学会年会的相干集会上，来自RGC的Joshua Backman（该论文的第一作者）指出，英国生物银行参加者的全基因组测序已经在举行中。
研究职员在论文中写道：“要实现我们最初的目的，即相识每小我私家类基因的遗传变异对康健的影响，大概必要对数百万具有精良特性和多样性的个别举行测序。”在我们看来，我们的研究效果不但评释这一目的是可以实现的，并且还评释，500万小我私家测序将使 “500+杂合 LOF”携带者辨认约 15 , 000 个基因。也便是说，是对绝大多数人类卵白质编码基因。”
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