约莫十年前,分子遗传学家就已经知道,基因组布局变异在植物和动物的顺应和标本化历程中可以发挥紧张作用,但他们对植物种群的顺应性的总体影响却不甚相识。这部门是由于正确的群体级布局变异的辨认必要阐发多个高质量的基因组组合,而这些组归并不遍及可用。在这项研究中,研究职员通太过析和比力可可树(Theobroma cacao)的31个天然产生的种群的染色体标准的基因组组合,观察了天然种群中基因组布局变异的顺应性结果。
可可树是巧克力的泉源,是长命树种。在这31个可可品系中,他们发觉了凌驾16万个布局变体。
在8月16日颁发在《美国国度科学院院刊》上的研究效果中,研究职员陈诉说,大多数布局变体是有害的,是以限定了可可植物的顺应性。他们指出,这些有害影响大概是基因功效受损的直接效果,也是恒久以来基因重组受到按捺的间接效果。
然而,只管有团体的倒霉影响,该研究还发觉了带有地方顺应性特性的个体布局变异,此中几个与差别种群之间表达的基因有关。参加病原体抗击的基因是这些候选基因之一,突出告终构变异对这一紧张的地方顺应性状的奉献。
一个研究小组对可可树的多个品系的基因组举行了细致和艰难的比力,使人们深入相识了基因组布局变异在基因表达和染色体进化的调控中所发挥的作用,引起了植物种群内的差别。
团队成员、J. Franklin Styer园艺植物学传授和宾夕法尼亚州立大学农业科学学院植物分子生物学传授Mark Guiltinan表现,这项对植物遗传学具有广泛意义的研究,在壮大的盘算机使高辨别率的基因组测序成为大概、包袱得起和相对快速之前是不行能的。
他说:“差别种群的可可树的基因组有99.9%是雷同的,但正是其基因组中非常之一的布局变异,决定了该植物在差别地域的多样性及其对天气和种种疾病的顺应性。"这项研究在布局变异和植物顺应本地情况的本领之间创建了联络。”
研究职员指出,总的来说,他们的研究效果为相识天然种群中布局变异体的顺应性效应的根本历程提供了紧张启发。他们以为,布局变异体影响了基因的表达,这很大概侵害了基因的功效并促成了其有害影响。他们还为一个理论猜测提供了履历上的支持,即布局变异导致基因重组的按捺,使植物更不行能顺应压力源。
Guiltinan指出,除了展现全部植物中布局变异的进化紧张性的新履历证据外,记载31个可可品系中的基因组差别和布局变异,为正在举行的这种宝贵植物的遗传和育种研究提供了珍贵的资源。
他表现:“全部的可可都来自亚马逊盆地--植物是好久曩昔由收罗者从田野收罗的,它们被克隆了,以是我们有一个永远的收藏。"它们的基因组已经被测序,这代表了大量的事情和数据。作为这项研究的效果,我们知道布局变异对植物的生存,对植物的进化,格外是对植物顺应本地条件非常紧张。”